La vena safena accessoria è collegata alla vena safena maggiore, che corre parallela ad essa, e si trova nella gamba e nella coscia. La grande vena safena è una grande vena superficiale (vicino alla superficie della pelle) che ha origine nel punto in cui l'arco venoso dorsale del piede si fonde con la vena dorsale dell'alluce. Percorre il lato mediale della gamba (più vicino al centro) dopo essere passato anteriormente al malleolo mediale, una proiezione ossea all'interno di ciascuna caviglia. La vena safena accessoria si unisce immediatamente prima che defluisca nella vena femorale.
Quando la vena safena accessoria raggiunge il ginocchio, viaggia posteriormente lungo le parti interne del ginocchio e della coscia e infine attraverso il bordo posteriore dell'epicondilo mediale dell'osso femorale, una proiezione ossea arrotondata all'estremità inferiore (distale) del femore dove si trova si collega al ginocchio. La vena safena accessoria viaggia quindi verso la superficie anteriore della coscia prima di entrare nello iato safeno, un'apertura di forma ovale nella fascia lata della coscia. La fascia lata è uno strato di tessuto connettivo fibroso che avvolge i muscoli della coscia. La vena si attacca quindi alla vena femorale nella giunzione safeno-femorale del triangolo femorale. Il triangolo femorale è una depressione nella parte superiore della parte interna della coscia che contiene il nervo femorale, l'arteria e le vene, nonché i linfonodi e i vasi.
La grande vena safena accessoria si ramifica in vene più piccole che sono fatte di fibra elastica. Queste vene hanno cellule muscolari diminuite e pareti sottili. Sono spesso la causa delle vene varicose, che si sviluppano quando si dilatano.